In Nachrichten, die über Nacht in den sozialen Medien gepostet wurden, sagte die Polizei, sie habe handeln müssen, um die Veranstaltung zu beenden und Zelte abzubauen, die von Demonstranten errichtet worden waren, die Steine und Feuerwerkskörper geworfen hatten.
Aufforderungen der Universität Amsterdam und des Bürgermeisters an die Demonstranten, den Campus zu verlassen, wurden ignoriert, so die Polizei.
Bis auf vier Demonstranten wurden alle später wieder freigelassen. Die vier wurden wegen öffentlicher Gewalt und Beleidigung eines Beamten länger festgehalten.
Ein Beamter erlitt einen Gehörschaden, sagte eine Polizeisprecherin und fügte hinzu, dass es noch unklar sei, wie viele andere Menschen verletzt worden sein könnten.
Die Universität von Amsterdam lehnte eine Stellungnahme ab, aber die Demonstranten hatten erklärt, sie forderten, dass die Schule ihre Beziehungen zu Israel abbricht.
"Der Einsatz der Polizei war notwendig, um die Ordnung wiederherzustellen. Wir haben die Aufnahmen in den sozialen Medien gesehen. Wir verstehen, dass diese Bilder als heftig erscheinen können", sagte die Polizei.
Der scheidende Bildungsminister Robbert Dijkgraaf sagte, Universitäten seien ein Ort des Dialogs und der Debatte und er sei traurig, dass die Polizei eingreifen musste.
Die Studentenproteste gegen den Krieg und die akademischen Beziehungen zu Israel haben begonnen, sich in ganz Europa auszubreiten, blieben aber in ihrem Ausmaß viel kleiner als in den Vereinigten Staaten.
Am vergangenen Freitag drang die Polizei in Paris in die renommierte französische Universität Sciences Po ein und entfernte studentische Aktivisten, die deren Gebäude besetzt hatten.
Mehr als 100 Studenten besetzen die Universität Gent in Belgien im Rahmen eines Klima- und Gaza-Protests, den sie bis Mittwoch verlängern wollen.
